L'endettement des établissements de santé, selon le rapport sur la santé publié en décembre 2004, fait état de plus de quatre milliards de dinars  dont 1,3 dus aux arriérés non réglés de personnels (indemnités de garde, primes de performances ,de contagion et d'intéressement).

Le reste des dettes est réparti comme suit : 2,418 milliards pour la Pch, 248,9 millions pour l'Institut Pasteur, 178,279 millions de créances de Sonelgaz, suivis de Socothyd, de l'Ade, de Naftal, de l'Institut médico-chirurgical…

Les dépenses de rémunération du personnel se stabilisent en moyenne autour de 68%, les dépenses de médicament  consommables et réactifs avoisinent les 83% du taux de fonctionnement. Quant aux dépenses de formation, y compris la rémunération des résidents et des internes, elles ne dépassent pas les 3% et la recherche médicale est inférieure à 0,5%